Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms