Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms