Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LynP25911 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LynP25911 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LynP25911 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LynP25911 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LynP25911 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LynP25911 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LynP25911 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms