Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf1bP25119 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1bP25119 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms