Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms