Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria1P23818 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms