Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsta3P23591 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsta3P23591 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms