Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms