Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eif3aP23116 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms