Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tap1P21958 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tap1P21958 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms