Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms