Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpcP21841 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpcP21841 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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SftpcP21841 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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SftpcP21841 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpcP21841 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SftpcP21841 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SftpcP21841 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SftpcP21841 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpcP21841 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SftpcP21841 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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SftpcP21841 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SftpcP21841 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SftpcP21841 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SftpcP21841 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SftpcP21841 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SftpcP21841 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SftpcP21841 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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SftpcP21841 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpcP21841 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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