Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp4P21275 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms