Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prim1P20664 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms