Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms