Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcaP20444 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms