Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TP20293 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TP20293 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TP20293 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TP20293 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TP20293 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TP20293 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TP20293 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TP20293 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TP20293 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TP20293 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TP20293 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms