Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox4i1P19783 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms