Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lama1P19137 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lama1P19137 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms