Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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