Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms