Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfb3P17125 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms