Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ass1P16460 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ass1P16460 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ass1P16460 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms