Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp53P15975 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp53P15975 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp53P15975 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp53P15975 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms