Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms