Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd44P15379 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd44P15379 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms