Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Msx1P13297 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx1P13297 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Msx1P13297 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx1P13297 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx1P13297 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Msx1P13297 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx1P13297 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Msx1P13297 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx1P13297 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx1P13297 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx1P13297 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx1P13297 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Msx1P13297 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx1P13297 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx1P13297 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx1P13297 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Msx1P13297 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Msx1P13297 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Msx1P13297 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx1P13297 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx1P13297 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Msx1P13297 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Msx1P13297 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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