Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms