Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timp1P12032 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Timp1P12032 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp1P12032 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp1P12032 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms