Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Itga5P11688 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms