Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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