Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fv4P11370 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms