Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms