Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms