Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatspereP0DP43 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms