Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dnmt3cP0DOY1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3cP0DOY1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms