Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf1P09925 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf1P09925 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf1P09925 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms