Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms