Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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