Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf1P07141 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms