Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa4P06728 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms