Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgamP05555 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgamP05555 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms