Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Eb1P04230 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms