Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04213 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04213 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04213 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04213 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04213 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04213 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P04213 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P04213 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P04213 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P04213 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms