Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb1P04202 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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