Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtnd1P03888 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms