Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01809 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01809 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01809 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms