Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01679 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01679 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01679 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01679 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01679 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01679 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01679 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01679 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms