Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tom1O88746 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1O88746 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms