Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms